Depèn, perquè no signifiquen el mateix.
Amb data indica la data de redacció d’un document, és a dir, la data que consta escrita en el document.
L’expressió de data és equivalent a amb data.
En data fa referència a la data de presentació o de recepció d’un document.
Aquestes expressions són útils en el llenguatge administratiu i jurídic, quan ens cal diferenciar la doble datació dels documents:
Totes tres (amb data, de data i en data) poden anar seguides de la preposició de (amb data de, de data de, en data de).